Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA6AP0CW24 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms