Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HSP90AB1P08238 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB1P08238 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms