Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A1BGP04217 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A1BGP04217 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A1BGP04217 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A1BGP04217 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A1BGP04217 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A1BGP04217 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A1BGP04217 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A1BGP04217 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
A1BGP04217 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A1BGP04217 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A1BGP04217 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A1BGP04217 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A1BGP04217 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A1BGP04217 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
A1BGP04217 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A1BGP04217 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A1BGP04217 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A1BGP04217 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A1BGP04217 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A1BGP04217 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A1BGP04217 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A1BGP04217 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A1BGP04217 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A1BGP04217 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A1BGP04217 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A1BGP04217 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A1BGP04217 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A1BGP04217 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A1BGP04217 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A1BGP04217 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A1BGP04217 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A1BGP04217 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A1BGP04217 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A1BGP04217 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A1BGP04217 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A1BGP04217 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A1BGP04217 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A1BGP04217 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A1BGP04217 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A1BGP04217 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A1BGP04217 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A1BGP04217 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A1BGP04217 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A1BGP04217 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A1BGP04217 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A1BGP04217 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A1BGP04217 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A1BGP04217 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A1BGP04217 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A1BGP04217 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A1BGP04217 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A1BGP04217 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A1BGP04217 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A1BGP04217 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A1BGP04217 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A1BGP04217 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A1BGP04217 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A1BGP04217 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A1BGP04217 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A1BGP04217 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A1BGP04217 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A1BGP04217 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
A1BGP04217 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
A1BGP04217 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
A1BGP04217 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
A1BGP04217 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
A1BGP04217 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
A1BGP04217 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
A1BGP04217 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
A1BGP04217 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
A1BGP04217 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
A1BGP04217 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
A1BGP04217 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
A1BGP04217 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A1BGP04217 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A1BGP04217 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A1BGP04217 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
A1BGP04217 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
A1BGP04217 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
A1BGP04217 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A1BGP04217 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms