Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRD4O60885 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRD4O60885 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRD4O60885 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRD4O60885 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRD4O60885 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRD4O60885 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
BRD4O60885 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRD4O60885 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
BRD4O60885 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD4O60885 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD4O60885 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD4O60885 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD4O60885 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD4O60885 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD4O60885 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD4O60885 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD4O60885 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD4O60885 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD4O60885 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD4O60885 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRD4O60885 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRD4O60885 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRD4O60885 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRD4O60885 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRD4O60885 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRD4O60885 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRD4O60885 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRD4O60885 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRD4O60885 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRD4O60885 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRD4O60885 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRD4O60885 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRD4O60885 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD4O60885 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD4O60885 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD4O60885 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD4O60885 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD4O60885 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD4O60885 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD4O60885 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD4O60885 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD4O60885 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRD4O60885 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRD4O60885 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRD4O60885 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRD4O60885 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRD4O60885 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRD4O60885 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BRD4O60885 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRD4O60885 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BRD4O60885 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRD4O60885 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRD4O60885 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BRD4O60885 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRD4O60885 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRD4O60885 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRD4O60885 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRD4O60885 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRD4O60885 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRD4O60885 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRD4O60885 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRD4O60885 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRD4O60885 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
BRD4O60885 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
BRD4O60885 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
BRD4O60885 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
BRD4O60885 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
BRD4O60885 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
BRD4O60885 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
BRD4O60885 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.16
BRD4O60885 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
BRD4O60885 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
BRD4O60885 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRD4O60885 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRD4O60885 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRD4O60885 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRD4O60885 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
BRD4O60885 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRD4O60885 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRD4O60885 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRD4O60885 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRD4O60885 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRD4O60885 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRD4O60885 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRD4O60885 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRD4O60885 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRD4O60885 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRD4O60885 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRD4O60885 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRD4O60885 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRD4O60885 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRD4O60885 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD4O60885 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD4O60885 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD4O60885 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD4O60885 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD4O60885 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD4O60885 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD4O60885 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms