Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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