Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C1D1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C1D1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C1D1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C1D1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C1D1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C1D1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C1D1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C1D1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C1D1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C1D1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C1D1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C1D1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C1D1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C1D1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C1D1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C1D1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C1D1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C1D1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C1D1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C1D1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C1D1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C1D1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C1D1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C1D1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C1D1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C1D1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C1D1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C1D1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C1D1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C1D1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms