Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HMGB1P1B2RPK0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms