Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms