Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2J1Q9Y385 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2J1Q9Y385 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms