Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM2AQ9Y2K7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM2AQ9Y2K7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms