Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT7Q9UIV1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms