Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms