Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SRP68Q9UHB9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRP68Q9UHB9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms