Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIP2Q9UDT6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms