Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
CC2D2AQ9P2K1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CC2D2AQ9P2K1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms