Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf109Q9NX04 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms