Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHPT1Q9NRX4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHPT1Q9NRX4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHPT1Q9NRX4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHPT1Q9NRX4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHPT1Q9NRX4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHPT1Q9NRX4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHPT1Q9NRX4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHPT1Q9NRX4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHPT1Q9NRX4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHPT1Q9NRX4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHPT1Q9NRX4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHPT1Q9NRX4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHPT1Q9NRX4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PHPT1Q9NRX4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHPT1Q9NRX4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHPT1Q9NRX4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHPT1Q9NRX4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHPT1Q9NRX4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms