Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRIP3Q9NQ35 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms