Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2TQ9NPD8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2TQ9NPD8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2TQ9NPD8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2TQ9NPD8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2TQ9NPD8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2TQ9NPD8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2TQ9NPD8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2TQ9NPD8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2TQ9NPD8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2TQ9NPD8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2TQ9NPD8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2TQ9NPD8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2TQ9NPD8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBE2TQ9NPD8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
UBE2TQ9NPD8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2TQ9NPD8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms