Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms