Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms