Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR12Q9C0I1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR12Q9C0I1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms