Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF17Q9BXT8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms