Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms