Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COPS4Q9BT78 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms