Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms