Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
YME1L1Q96TA2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YME1L1Q96TA2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms