Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC17Q96LX7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC17Q96LX7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms