Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
LRIG1Q96JA1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms