Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C6Q969F1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms