Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BHMTQ93088 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BHMTQ93088 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHMTQ93088 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHMTQ93088 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHMTQ93088 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BHMTQ93088 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BHMTQ93088 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BHMTQ93088 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BHMTQ93088 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHMTQ93088 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BHMTQ93088 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHMTQ93088 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMTQ93088 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMTQ93088 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHMTQ93088 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHMTQ93088 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMTQ93088 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMTQ93088 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMTQ93088 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BHMTQ93088 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMTQ93088 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMTQ93088 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMTQ93088 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMTQ93088 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHMTQ93088 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHMTQ93088 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHMTQ93088 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMTQ93088 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHMTQ93088 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHMTQ93088 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHMTQ93088 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHMTQ93088 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BHMTQ93088 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BHMTQ93088 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHMTQ93088 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHMTQ93088 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHMTQ93088 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BHMTQ93088 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BHMTQ93088 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHMTQ93088 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHMTQ93088 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHMTQ93088 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHMTQ93088 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMTQ93088 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms