Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUBCNQ92622 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUBCNQ92622 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms