Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOPBP1Q92547 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms