Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL11Q8NHH1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL11Q8NHH1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms