Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms