Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIEQ8NEW7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIEQ8NEW7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms