Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZNF548Q8NEK5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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