Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACBD4Q8NC06 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms