Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms