Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPAS3Q8IXF0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms