Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC83Q8IWF9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC83Q8IWF9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms