Protein–RNA interactions for Protein: Q86W67

FAM228A, Protein FAM228A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228AQ86W67 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228AQ86W67 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228AQ86W67 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228AQ86W67 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228AQ86W67 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228AQ86W67 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228AQ86W67 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228AQ86W67 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228AQ86W67 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228AQ86W67 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM228AQ86W67 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228AQ86W67 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms