Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D4Q7Z3S7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms