Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms