Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms