Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD3Q5T447 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms