Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms