Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms