Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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RAB6CQ53S08 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB6CQ53S08 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6CQ53S08 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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