Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf17Q53FE4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms